在一個炎熱的夏天，地球正蔓延着一種新病毒---豬流感。人們都聞「豬」色變，而政府更宣佈所有豬豬要自我隔離，直至新的疫苗面世。

在N市裏，三隻小豬兄妹被迫留在家裹，他們的名字是大哥豬、二哥豬和三妹豬。由於他們的爸爸豬很早就病死了，而媽媽豬要出外工作，沒有時間管教他們；正所謂「慈母多敗兒」，故大哥豬性情暴躁，二哥豬性格懶散，三妹豬為人自私。平日三兄妹除了吃和睡，很少會一起待在家中。

這天，大哥豬正在上網，二哥豬正在玩遊戲機，而三妹豬用電話跟朋友聊天。突然廚房傳來「呯」的一聲，正在上網的大哥豬跑去看個究竟，發現媽媽豬暈倒在地上。大哥豬立刻報警求助，但警員聽到是豬豬家，竟然馬上掛線！

三隻小豬把媽媽豬抬到附近的診所，但護士們看到他們是豬，都拒「豬」門外，不願為媽媽豬治病，於是他們便向中醫師鄰居朱豬博士求助。

朱豬博士檢查過後說：「你們的母親患上了豬流感！」三隻小豬聽後嚇了一跳。「朱豬博士，怎樣才可以治好媽媽豬的病呢？」「有一位居住在艱巨山的智者，他研製了一種可以醫好豬流感的新藥，那是你們唯一的希望了！但爬上艱巨山，必需要無比的勇氣、耐力和團結的精神，你們願意接受挑戰嗎？」

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