小琴公主看見小直王子變成了一隻青蛙後，跳入池塘，把她嚇得不知所措，深怕以後再也不能與這位好友相聚，只好用眼淚來掩飾這一切。邪惡黑魔士—亞利大人心有不甘，但深明大勢已去，準備放棄的時候，靈光一閃，其落寞的表情亦隨之揮去。他認為這女孩有可取之處，說不定她可能知道那該死王子的祕密，所以他決定捉回去後，再作處置。小琴公主在旁聲淚俱下，沒有留意自己已陷入困境……她來不及定神，已被捉去了。

另一邊廂，小直王子卻趨吉避凶，當然他自己依然不知道那顆明珠的存在，只是聽過相關的傳說。他正為自己變成一隻青蛙而煩惱，卻忘記了他的好朋友—小琴的安危。這時，牧場主人剛好帶他的動物到池邊喝水，亦巧合地看到由小直王子變成的青蛙，就想起女兒—小瑜，急需要找隻青蛙上生物科的解剖課，便馬上把他撿回家去。回到家裏，牧場主人看到小瑜愁眉苦臉的，就馬上從口袋裏拿出那特別帥的青蛙—小直王子，小瑜馬上為「牠」著迷。

過了幾天，就到了解剖的那天，小瑜還未能找到別的青蛙來代替小直王子，所以她把心一橫，就把小直王子放到解剖刀下。此時，小直王子急得快哭出來了。只要一想到自己快死了，又不能跟朋友、家人道別，心中就一直淌淚。一瞬間，小直王子肚裏的明珠又發光了，把他變回原貌。這舉將小瑜和其他同學都嚇呆了，而任教老師亦當場暈倒。為了盡快結束是次險象環生的經歷，所以他拔腿就跑。他一直一直跑，又跑到池塘去了。他用清澈的池水來洗洗臉，就一直盯着水中的自己。他在想:我真是牧場主人的兒子嗎?小直王子從小到大都沒有懷疑過自己的身分，這是第一次。經過這幾天的青蛙生活，讓他反覆思考，慢慢地開始對自己身分起疑……想着、想着，小直王子猛然想起了自己那位一見如故的好朋友，但是他還決定先把事情弄清楚，才去探訪那位好朋友。他趕快跑回家，哀求牧場主人說出他真正的身分。最初，牧場主人支支吾吾的，但在他苦苦哀求下，坦然道出事。小直王子感到驚訝非常，但牧場主人又不知道誰是他親生父母，所以他毅然踏上「尋親之旅」。

在小直王子快出門的時候，有人大喊:「號外!小琴公主被抓走了!下落不明!」小直王子心感不妙，只好暫時擱置這個計劃。幾經打探，他終於到了一個非常邪惡的島。這個島一年三百六十五天都被霧圍繞着，而且風勢很大，凡登上這個島，就有百分之九十九被嚇呆，所以有「嚇人島」的稱號。經「過五關，斬六將」的考驗後，小直王子把黑魔士殺死了，並將小琴公主救了出來。小琴公主緊緊地擁抱着他，這件事讓他們感情昇華，朋友變成情人。他們二人明查暗訪後，來到了一間外表破爛不堪的茅屋。屋裏的主人聽到腳步聲，就開門了。小直王子看見門開了，心情亦變緊張起來了，他們二人一步一步地走進去了。裏面裝修得瑰麗堂皇，就連小琴公主亦瞠目結舌。這他們面前出現了一對憔悴的中年夫婦，他們也就是小直的父皇和母后。在小直的記憶中，父母的印象模糊，但卻有種熟悉的感覺。他再按捺不住地叫了聲爸媽，等了很久的一句話啊!他們幾個都感動得眼淚一直流，並沒有停止的意思。他們聊了很久，把一切的都吿訴小直王子，他慢慢灺接受了這些事實。他們看見小琴公主深愛著小直王子，決定為他們舉行婚禮，讓這夢幻的童話延續下去……